首先登录平台后点击【抵扣勾选】-【发票抵扣勾选】，直接选择【开票日期】查询该时间段内可抵扣的发票，另点击网页右侧【更多查询条件】按钮，可浏览更多查询条件，再次点击则收起下拉菜单，也可以默认选择。
然后确认【认证状态】为：未认证，确认【勾选状态】为：未勾选；查询条件选择后，点击【查询】按钮，之后会跳出发票数据，在需要勾选的发票前打勾；完成勾选后，点击底部【提交】按钮，该步骤在所属税期中可以多次操作；最后提交后系统弹出提示页面，点击【确定】完成【抵扣勾选】操作。
发票认证是指本企业购进，用于在生产或在销售的商品及原材料收到的增值税专用发票，需要进行进项税抵扣的需要进行认证，认证期限是发票开出90天之内，一般要携带认证发票的抵扣联发票联和税务登记证副本进行发票认证。
拿到增值税发票后持第一联抵扣联及发票联到管辖国税局去认证发票真假，认证通过就可抵扣税款，即本月应交国税=本月销项税减进项税，增值税发票要在90天以内去认证，否则不予抵扣。
